Dedicated DNA microarray - специфичный ДНК микрочип в диагностике глазных заболеваний

ДНК-микрочип - аллель-специфический микрочип, основанный на платформе матриксной гибридизации реакций сотен и тысяч различных точечно расположенных зондов с известной (dedicated) мутацией или SNP (заменой одного нуклеотида) при исследовании амплифицированной ДНК исследуемого пациента в отличие от generic (типичный) микрочипа, когда олигонуклеотидная матрица расположена рандомно. Микрочип состоит из тысяч микроскопических точек дезокси- олигонуклеотидов. Каждая точка содержит порядка пикомолей ДНК специфической последовательности. Олигонуклеотид может являться коротким участком гена или другого компонента ДНК, и используется для гибридизации с кДНК или мРНК. Гибридизация зонда и мишени регистрируется и количественно определяется при помощи флюоресценции или хемолюминесценции, что позволяет определять относительное количество нуклеиновой кислоты с заданной последовательностью в образце.

В обычном ДНК микрочипе зонды ковалентно прикрепляются к твердой поверхности — стеклянному или кремниевому чипу. Другие платформы, например, выпускаемые Illumina , используют микроскопические шарики вместо больших твердых поверхностей. ДНК микрочипы отличаются от других микрочипов только тем, что их применяют для измерения ДНК или как часть более сложной системы детекции и анализа ДНК.

ДНК микрочипы используют для анализа изменения экспрессии генов , выявления однонуклеотидных полиморфизмов , генотипирования или повторного секвенирования мутантных геномов . Микрочипы отличаются по конструкции, особенностям работы, точности, эффективности и стоимости.

Типы генетической диагностики в офтальмологии: